2026-06-18 6635957 10701333.zip 2026-06-18 Digital.CSIC Agencia Estatal Consejo Superior de Investigaciones Científicas ICU = EEZA oai:digital.csic.es:10261/386772 OAI-PMH OAI text/plain 2026-06-18 2026-06-18 7955 README.txt 2026-06-18 2024-02-25 ICU = EEZA oai:digital.csic.es:10261/386772 OAI-PMH OAI text/plain 2026-06-18 2026-06-18 Crecimiento y Supervivencia de parcelas de espacio y subsuelos a través de Danum Valley 2004 - 2017 [Dataset] (Traducción automática) Growth and Survival of gap and understorey plots across Danum Valley 2004 - 2017 [Dataset] http://hdl.handle.net/10261/386772 info:eu-repo/semantics/dataset Descripción de Experimento y Recopilación de Datos Este experimento se realizó en el Centro de Campo del Valle del Danum (N04.96° E117.80°; 180 MASL), Sabah, Malasia. El centro de campo forma parte del Área de Conservación del Valle del Danum (DVCA), un área de 43800 hectáreas de bosque primario bajo dominado por la Familia Dipterocarpaceae (dipterocarps). El experimento se plantó en noviembre de 2004 a lo largo del bosque primario sur y oeste del centro de campo. Veinte parcelas fueron colocadas a través de un amplio rango de tamaño (12 – 400 m2) de aberturas de canopy natural (gaps) y emparejados con parcelas idénticas bajo canopy cerrado (compstorey) Los sitios de subsuelo se colocaron a 30 metros de cada brecha de caída de árboles en una brújula aleatoria. Las parcelas combinadas de espacio y subsuelo representan un bloque. Se colocaron bloques en toda la gama de topografías encontradas en el Valle del Danum, donde 6 bloques estaban en zonas de riparia de tierras bajas, 7 bloques estaban en zonas bajas de los ríos y 7 bloques estaban en sitios de subida (Fig. S1 en la Información Suplementaria). La elevación media en todas las parcelas fue de 249 m (rango = 203 – 319 m) y la pendiente media fue de 20 grados (rango = 3 – 56 grados). Dentro de cada parcela desnivel y subsuelo, se plantaron dos subsuelos idénticos con plántulas de 25 especies de árboles en 0,75 × 0,75 m espaciamiento para un total de cuatro subsuelos por par desniveles y un total de 80 subsuelos (20 pares × 2 parcelas desnivel/desperdicio × 2 subs = 80 subs). Debido a la producción de semillas poco frecuente de especies de árboles en los bosques de Borneo de tierras bajas, las especies fueron seleccionadas principalmente sobre la base de la disponibilidad en guarderías locales (véase el cuadro S3 en Información complementaria para información sobre especies). Veinticuatro especies fueron dipterocarps que abarcaban cinco géneros (Dipterocarpus, Dryobalanops, Hopea, Parashorea y Shorea) y una especie de Bombaceae (honolens neureños). Dentro de cada subploto, las especies fueron asignadas aleatoriamente un punto de plantación, por lo tanto, los 80 subplots tenían un patrón de plantación diferente. Seis meses después de la plantación, para permitir la mortalidad debido al estrés de plantación (que fue replantado después de uno y tres meses), se midieron las plantas para altura y diámetro en la base (10 cm desde la superficie del suelo). De 2004 a 2007 se midieron plántulas cada 6 meses después de los cuales se midieron aproximadamente anual entre 2007 y 2017. En este análisis no se incluyó un censo, ya que se midió sólo 3 meses después del censo anterior, lo que dio lugar a un total de 16 censos. Estas mediciones de crecimiento se utilizaron para calcular la tasa de crecimiento relativa como la diferencia en el diámetro log entre dos mediciones divididas por el número de días entre mediciones estandarizadas al año dividiendo días en 365.25. Descripción de cada columna en DataGrowthSurvivalClean.txt Bloqueo - Gap / par de tienda (variable categórica de 1 a 20) pid - ID de Parcela (variable categórica de 40 parcelas) Survey.date - Fecha de medición (DD/MM/YYYYY) Día - Julián día Año - Año del censo Censo - Número de censo Canopy - Designación de gap o subsuelo (Categorical variable U/G) Parcela - Número de parcela (variable categórica de 1 a 40) Subplot - Subplot within plot (Categorical variable A/B) Subplot.no - Subplot number (Categorical variable from 1 to 80) Genus - Genus Especies - Epíteto específico Sp - ID único de las primeras 3 letras del género y las primeras 3 letras del epíteto específico Plant.id - ID para cada individuo (variable categórico del 1 al 2000) Diam1 - Diámetro en medición de base Diam2 - Diámetro en medición de base DBH.1 - Diámetro en altura de pecho de más de 1.3 m DBH.2 - Diámetro en altura de pecho de más de 1.3 m Altura. apex - Altura al brote apical diam - Promedio de dos mediciones de diámetro dbh - Promedio de dos mediciones DBH luz - Luz porcentual en la trama medida al inicio del experimento déficit - Promedio mínimo de 30 días de déficit de precipitación desde el último censo cero - Número de días sin lluvia desde el último censo seco - Número de días del período seco más largo desde el último censo exceso - Máximo promedio de 30 días de exceso de precipitación desde el último censo sol - Hora media por día desde el último censo lluvia - Designación de las condiciones de precipitación desde el último censo (déficit de Wet √≥ -50 mm, Seco y déficit de 100 mm, Sequía tratado - Designación si la lámina plástica se aplica a la trama para el período (No hay plástico, Exclusión de precipitación plástica en seco) supervivencia en el censo (1 = vivo, 0 = muerto) rgr - Tasa de crecimiento relativa para el diámetro en la base elev - elevación de la trama slp - Pendiente de trama topo - Designación de la ubicación de la parcela (variable categórica de Lowland, Riparian y Ridge) Descripción de RCode GrowthSurvivalGlobalFinal.R - Código para el análisis del crecimiento global y la supervivencia Figuras 2 y 3 PlotsSpeciesResponses.R - Código para generar la Figura 4 y 5 de la salida de Rstanarm FitnessDiferencias.R - Código para generar la Figura 6 de la salida de Rstanarm (Traducción automática) Description of Experiment and Data Collection This experiment was conducted at the Danum Valley Field Centre (N04.96° E117.80°; 180 MASL), Sabah, Malaysia. The field centre is part of the Danum Valley Conservation Area (DVCA), a 43800-ha area of primary lowland forest dominated by the Family Dipterocarpaceae (dipterocarps). The experiment was planted in November 2004 throughout the primary forest south and west from the field centre. Twenty plots were placed across a large size range (12 – 400 m2) of natural canopy openings (gaps) and paired with identical plots under closed canopy (understorey) Understorey sites were placed 30 meters from each tree-fall gap at a random compass bearing. The combined gap and understorey plots represent a block. Blocks were placed across the range of topography found in Danum Valley whereby 6 blocks were in lowland riparian areas, 7 blocks were in lowland areas away from rivers and 7 blocks were on upslope sites (Fig. S1 in the Supplementary Information). The mean elevation across all plots was 249 m (range = 203 – 319 m) and the mean slope was 20 degrees (range = 3 – 56 degrees). Within each gap and understorey plot, two identical subplots were planted with seedlings of 25 tree species at 0.75 × 0.75 m spacing for a total of four subplots per gap-understorey pair and a total of 80 subplots (20 pairs × 2 gap/understorey plots × 2 subplots = 80 subplots). Due to the infrequent seed production of tree species in lowland Borneo forests, species were selected mainly based on availability in local nurseries (see Table S3 in Supplementary Information for species information). Twenty-four species were dipterocarps spanning five genera (Dipterocarpus, Dryobalanops, Hopea, Parashorea and Shorea) and one species of Bombaceae (Durian graveolens). Within each subplot, species were randomly assigned a planting point, therefore, all 80 subplots had a different planting pattern. Six months after planting—to allow for mortality due to planting stress (which was replanted after one and three months—seedlings were measured for height and diameter at base (10 cm from soil surface). From 2004 to 2007 seedlings were measured every 6 months after which they were measured approximately yearly from 2007 to 2017. One census was not included in this analysis because as it was measured only 3 months after the previous census, which led to a total of 16 censuses. These measurements of growth were used to calculate relative growth rate as the difference in log-diameter between two measurements divided by the number of days between measurements standardized to year by dividing days by 365.25. Description of each column in DataGrowthSurvivalClean.txt Block - Gap/understorey pair (Categorical variable from 1 to 20) pid - Plot ID (Categorical variable of 40 plots) Survey.date - Date of measurement (DD/MM/YYYY) Day - Julian day Year - Year of census Census - Census number Canopy - Gap or understorey designation (Categorical variable U/G) Plot - Plot number (Categorical variable from 1 to 40) Subplot - Subplot within plot (Categorical variable A/B) Subplot.no - Subplot number (Categorical variable from 1 to 80) Genus - Genus Species - Specific epithet Sp - Unique ID of first 3 letters of genus and first 3 letters of specific epithet Plant.id - ID for each individual (Categorical variable from 1 to 2000) Diam1 - Diameter at base measurement Diam2 - Diameter at base measurement DBH.1 - Diameter at breast height of taller than 1.3 m DBH.2 - Diameter at breast height of taller than 1.3 m Height.apex - Height to apical bud diam - Average of two diameter measurements dbh - Average of two DBH measurements light - Percent light in the plot measured at the start of the experiment deficit - Minimum 30-day average of rainfall deficit since last census zero - Number of days with no rain since last census dry - Number of days of the longest dry period since last census excess - Maximum 30-day average of rainfall excess since last census sun - Average sun hour per day since last census rain - Designation of rainfall conditions since last census (Wet > -50 mm deficit, Dry <-50 and >-100 mm deficit, Drought <-100 mm deficit) treat - Designation if plastic sheeting was applied to plot for the period (Everwet no plastic, Drought plastic rainfall exclusion) surv - Survival at census (1 = alive, 0 = dead) rgr - Relative growth rate for diameter at base elev - Plot elevation slp - Slope of plot topo - Designation of plot location (Categorical variable of Lowland, Riparian and Ridge) Description of RCode GrowthSurvivalGlobalFinal.R - Code for analysis of global growth and survival Figures 2 and 3 PlotsSpeciesResponses.R - Code to generate Figure 4 and 5 from Rstanarm output FitnessDifferences.R - Code to generate Figure 6 from Rstanarm output 2024-02-25 conforme-DCAT-AP-ES Digital.CSIC Agencia Estatal Consejo Superior de Investigaciones Científicas Agencia Estatal Consejo Superior de Investigaciones Científicas EA0041268 DIGITAL.CSIC 2024-02-25 DIGITAL.CSIC 2026-08-20T11:30:09.354641+02:00 2026-06-22T10:10:30.360367+02:00