Growth and Survival of gap and understorey plots across Danum Valley 2004 - 2017 [Dataset]

Descripción de Experimento y Recopilación de Datos

Este experimento se realizó en el Centro de Campo del Valle del Danum (N04.96° E117.80°; 180 MASL), Sabah, Malasia. El centro de campo forma parte del Área de Conservación del Valle del Danum (DVCA), un área de 43800 hectáreas de bosque primario bajo dominado por la Familia Dipterocarpaceae (dipterocarps).

El experimento se plantó en noviembre de 2004 a lo largo del bosque primario sur y oeste del centro de campo. Veinte parcelas fueron colocadas a través de un amplio rango de tamaño (12 – 400 m2) de aberturas de canopy natural (gaps) y emparejados con parcelas idénticas bajo canopy cerrado (compstorey) Los sitios de subsuelo se colocaron a 30 metros de cada brecha de caída de árboles en una brújula aleatoria. Las parcelas combinadas de espacio y subsuelo representan un bloque. Se colocaron bloques en toda la gama de topografías encontradas en el Valle del Danum, donde 6 bloques estaban en zonas de riparia de tierras bajas, 7 bloques estaban en zonas bajas de los ríos y 7 bloques estaban en sitios de subida (Fig. S1 en la Información Suplementaria). La elevación media en todas las parcelas fue de 249 m (rango = 203 – 319 m) y la pendiente media fue de 20 grados (rango = 3 – 56 grados). Dentro de cada parcela desnivel y subsuelo, se plantaron dos subsuelos idénticos con plántulas de 25 especies de árboles en 0,75 × 0,75 m espaciamiento para un total de cuatro subsuelos por par desniveles y un total de 80 subsuelos (20 pares × 2 parcelas desnivel/desperdicio × 2 subs = 80 subs). Debido a la producción de semillas poco frecuente de especies de árboles en los bosques de Borneo de tierras bajas, las especies fueron seleccionadas principalmente sobre la base de la disponibilidad en guarderías locales (véase el cuadro S3 en Información complementaria para información sobre especies). Veinticuatro especies fueron dipterocarps que abarcaban cinco géneros (Dipterocarpus, Dryobalanops, Hopea, Parashorea y Shorea) y una especie de Bombaceae (honolens neureños). Dentro de cada subploto, las especies fueron asignadas aleatoriamente un punto de plantación, por lo tanto, los 80 subplots tenían un patrón de plantación diferente.

Seis meses después de la plantación, para permitir la mortalidad debido al estrés de plantación (que fue replantado después de uno y tres meses), se midieron las plantas para altura y diámetro en la base (10 cm desde la superficie del suelo). De 2004 a 2007 se midieron plántulas cada 6 meses después de los cuales se midieron aproximadamente anual entre 2007 y 2017. En este análisis no se incluyó un censo, ya que se midió sólo 3 meses después del censo anterior, lo que dio lugar a un total de 16 censos. Estas mediciones de crecimiento se utilizaron para calcular la tasa de crecimiento relativa como la diferencia en el diámetro log entre dos mediciones divididas por el número de días entre mediciones estandarizadas al año dividiendo días en 365.25.

Descripción de cada columna en DataGrowthSurvivalClean.txt

Bloqueo - Gap / par de tienda (variable categórica de 1 a 20)

pid - ID de Parcela (variable categórica de 40 parcelas)

Survey.date - Fecha de medición (DD/MM/YYYYY)

Día - Julián día

Año - Año del censo

Censo - Número de censo

Canopy - Designación de gap o subsuelo (Categorical variable U/G)

Parcela - Número de parcela (variable categórica de 1 a 40)

Subplot - Subplot within plot (Categorical variable A/B)

Subplot.no - Subplot number (Categorical variable from 1 to 80)

Genus - Genus

Especies - Epíteto específico

Sp - ID único de las primeras 3 letras del género y las primeras 3 letras del epíteto específico

Plant.id - ID para cada individuo (variable categórico del 1 al 2000)

Diam1 - Diámetro en medición de base

Diam2 - Diámetro en medición de base

DBH.1 - Diámetro en altura de pecho de más de 1.3 m

DBH.2 - Diámetro en altura de pecho de más de 1.3 m

Altura. apex - Altura al brote apical

diam - Promedio de dos mediciones de diámetro

dbh - Promedio de dos mediciones DBH

luz - Luz porcentual en la trama medida al inicio del experimento

déficit - Promedio mínimo de 30 días de déficit de precipitación desde el último censo

cero - Número de días sin lluvia desde el último censo

seco - Número de días del período seco más largo desde el último censo

exceso - Máximo promedio de 30 días de exceso de precipitación desde el último censo

sol - Hora media por día desde el último censo

lluvia - Designación de las condiciones de precipitación desde el último censo (déficit de Wet √≥ -50 mm, Seco y déficit de 100 mm, Sequía

tratado - Designación si la lámina plástica se aplica a la trama para el período (No hay plástico, Exclusión de precipitación plástica en seco)

supervivencia en el censo (1 = vivo, 0 = muerto)

rgr - Tasa de crecimiento relativa para el diámetro en la base

elev - elevación de la trama

slp - Pendiente de trama

topo - Designación de la ubicación de la parcela (variable categórica de Lowland, Riparian y Ridge)

Descripción de RCode

GrowthSurvivalGlobalFinal.R - Código para el análisis del crecimiento global y la supervivencia Figuras 2 y 3

PlotsSpeciesResponses.R - Código para generar la Figura 4 y 5 de la salida de Rstanarm

FitnessDiferencias.R - Código para generar la Figura 6 de la salida de Rstanarm (Traducción automática)